در این بخش که یکی از مهمترین و فعال ترین بخش های هر آزمایشگاه پزشکی می باشد، مجموعه متنوعی از آزمایشات انجام می گیرد مانند:آزمایشات قند، اوره، چربی خون، آنزیم های کبدی و قلبی، سدیم، پتاسیم، آهن و...
با افتخار به اطلاع می رساند که آزمایشگاه پاتوبیولوژی فارابی مجهزبه دستگاه اتوانالایزر تمام اتوماتیک Hitachi 912 گردیده است که با این دستگاه بسیار خوب میتوان طیف وسیعی از تستهای تخصصی بیوشیمی را در زمان بسیار کوتاهی به انجام رساند.

دستگاه الکترولیت آنالایزر استارلایتV ساخت کمپانی آلفا واسرمن امریکاجهت اندازه گیری تستهای Na, K, Li, CL و کلسیم یونیزه خون و مایعات بدن

روش روتین اندازه گیری بیلیروبین همان دیازو است ولی دستگاه های بیلیروبینومتر هم براساس رنگ سنجی بوسیله لوله موئینه میکروهماتوکریت این کار را انجام میدهند مانند دستگاه Billi Test A

دستگاه فتومتر Visual از کمپانی بیومریو ، توانایی انجام کلیه تستهای بیوشیمی و الایزا بصورت دستی را داشته و در مواقع اورژانسی از این دستگاه استفاده می شود.

جهت اندازه گیری پروتئین هایی با مقادیر کم مانند میکروآلبومین HbAlc
